Với định hướng gìn giữ, bảo tồn, nâng tầm và khẳng định tinh hoa YHCT, Viện Y Dược cổ truyền dân tộc luôn cố gắng phát triển, hoàn thiện tốt tất cả các hoạt động chuyên môn liên quan trong lĩnh vực. Mong muốn từ đó đóng góp nhiều hơn vào công cuộc “hiện đại hóa” nền YHCT và nâng cao chất lượng - hiệu quả công tác chăm sóc sức khỏe cộng đồng. 

Viện tập trung đầu tư và đẩy mạnh các hoạt động chuyên môn như: Nghiên cứu khoa học; Nghiên cứu, phát triển các sản phẩm/ dịch vụ khám chữa bệnh và chăm sóc sức khỏe; Nghiên cứu, chuyển giao dịch vụ Khoa học & Công nghệ; Nghiên cứu, phát triển dược liệu và tập huấn, đào tạo, phát triển nhân lực trong lĩnh vực YHCT.